Es una obra del arquitecto Mariano de las Casas y Francisco Martínez, donde su fachada y torre tienen influencia árabe. Es una iglesia de los más representativos de nuestro Estado gracias a su arquitectura y al elaborado trabajo de sus retablos. Sus paredes encierra más de 200 años de historia y obras de arte inigualables.
El primer cuerpo ostenta el primer reloj de tres carátulas que se construyó en América. Desde lejos se puede apreciar la cúpula en la que se destaca su linternilla, la policromía del tambor octogonal y las columnillas y otros relieves de cantera que resguardan los ventanales.
Asimismo, cuenta con el 1er. reloj de tres carátulas que se construyó en América, en el coro alto está un órgano Walcker, de principios de siglo y su sacristía está el retrato de la hermana Ana María de San Francisco y Neve, famosa pintura novohispana.
El 28 de febrero se inauguró el Museo de Sitio, donde en la primera sala se exhibe la vida ordinaria de las Madres Rosas, donde se colocaron los documentos, utensilios y pinturas de las religiosas que habitaron el Real Colegio de Santa Rosa de Viterbo. Y en la segunda sala contiene las esculturas, pinturas, vestimentas, mobiliario, entre otros objetos de valor patrimonial para los mexicanos por su significado en la historia del país.
Los horarios son de martes a domingo de 11 a 17 hrs., con un costo de $30 pesos.
También se puede disfrutar el lugar donde muchos queretanos de antaño mencionaban que el fantasma de una monja deambulaba por el altar antiguo del templo y los pasillos de esta gran obra arquitectónica. Cuenta la leyenda que ella era una mujer de una familiar acaudalada y decidieron mandarla al convento; sin embargo, ella estaba enamorada de un hombre y por la separación decidió suicidarse.